En novembre 2016, lelanceur.fr révélait les pratiques désastreuses de la direction du Cned et de son directeur Jean-Charles Watiez. Moins d’un mois après ces révélations une enquête a été ouverte par l’Éducation nationale et le directeur général a dû démissionner.
Aujourd'hui l'institution essaie de redorer son blason, mais doit composer avec les affaires laissées par son prédécesseur notamment sur le favoritisme dans certains marchés public. Selon le site internet "7 à Poitiers", "au moins deux contrats feraient l’objet de recours auprès du procureur de la République de Poitiers, Michel Garrandeaux".